Piispa on kirkon hengellinen ja hallinnollinen johtaja. Kirkon seurakunnat sekä papit ja diakonit ovat hänen johdettaviaan. Piispa toimii sekä kirkkohallituksen että kirkolliskokouksen puheenjohtajana. Piispan sijaisena toimii kirkkohallituksen nimeämä vikaari, joka on joku lääninrovasteista.  

Piispa valitaan kirkolliskokouksen istunnossa, jonka kutsuu koolle kirkkohallitus. Piispan vaalissa äänioikeus on kaikilla kokouksessa läsnä olevilla kirkolliskokouksen jäsenillä sekä virassa olevilla papeilla ja diakoneilla.

Piispa valitaan pappien keskuudesta. Kirkolliskokouksen hyväksymien ehdokkaiden on oltava Venäjän kansalaisia.

Piispoina Inkerin kirkossa ovat toimineet:

Felix Relander1921-1923
Selim Jalmari Laurikkala1924-1937
Leino Hassinen1993-1995
Aarre Kuukauppi1996-